不一定，公对私转账分为行内转账和跨行转账，根据到账时间的不同又分为实时转账和普通转账。
1.行内转账时，公对私转账的申请提交后可以实现实时到账，不会有时间上的延迟；
2.跨行转账需要在两家银行之间进行转账，提交申请后的到账时间依照不同的转账方式来确定：快速转账可以让银行优先处理，最长不会超过2小时，普通转账的到账时间会延长至2-3个工作日。
普通人转账50万是会查的，因为用户单笔或者单日累计转账金额在50万及以上，那么就属于是大额交易范畴。只要资金来源合法，交易正常，那么转账是不会影响的。
这个问题要根据转账交易是否涉及违规、违法而定。如果企业单位对公账户向个人私户转账属于正常结算支付的，如，发放员工工资，报销费用等，就不会查。如果涉嫌违法违规行为的会查。