该工程经过六安以下地方：
（涉及六安市部分）。
金安区；
木厂镇 岗郢村、新塘村、杨桥村
马头镇 崔店村、十字路村、黄店村、李大楼村
翁墩乡 杨公村、孔树村、郑楼村
舒城县；
杭埠镇 胡同村、孙圩村、五联村、大兴村、太平村、保靖村、汪圩村、五星村、薛泊村、三蕊村、六从村、郑圩村
千人桥镇 路里村、张湾村、孙湾村、周圩村、千人桥村
城关镇 梵坛村、舒丰村
百神庙镇 元棚村、郑圩村、杨圩村、舒房村、林波村、舒合村、中心村、方圩村
霍邱县；
周集镇 燎东村、新圩村
王截流乡 韩台村、张岭村、东湾村、王楼村、李郢村、陈郢村、南滩村、下楼村、朱张村
临淮岗乡 后楼村、甘花园村
新店镇 新店村
不经过六安。从寿县城北到瓦埠湖往南，再经过肥西、舒城、庐江、无为，最后并入长江
引江济淮工程并没有经过毛集实验区，实验区位于淮河以南，而该工程主要是为了解决江苏省北部和淮河流域的水资源短缺问题，通过引东山水、开挖南淝河以及修建近百公里输水管线等方式向这些地区输送水源，因此并没有经过毛集实验区。