确切的说是合规。根据国家最新规定，事业单位和公务员因私护照和港澳通行证都必须交给单位的人事部门保管，如果需要使用，需要经过有关领导批准后，人事部门发放所需证件。所以说，事业单位收港澳通行证合规。
事业单位收到的个人往来款应该分别入账，以便核对账目。具体操作可先将往来款按个人名称归类，再由专人进行入账，按照会计科目分别记账，并及时做好相关凭证。
在核对账目时，应以收款单、发票等为凭证，与记账凭证核对。同时，注意将往来款存放在专门的往来款账户中，做好资金的使用和管理，以保证账目准确无误。
社保可以在企业缴纳。事业单位原来没缴纳社保的，按视同缴费年限计算。事业单位人员调到企业工作，社保按企业职工缴纳即可。